Os livros que preencheriam as estantes perderam-se aquando da extinção das Ordens Religiosas em Portugal determinada, em 1834, pelo regime de monarquia liberal que se sucedeu à guerra civil, e na sequência da qual os bens das ordens religiosas reverteram a favor do Estado. O recheio do convento foi vendido em hasta pública e disperso, razão pela qual o acervo desta biblioteca é hoje desconhecido.