Le cloître, entouré d'une dense végétation autochtone, était le lieu où se pratiquait la contemplation. Du cloître part un chemin qui mène au vestibule, l'entrée habituelle du couvent. Il est également possible de se rendre à une petite dépendance extérieure, l'herbolarium, qui abrite un ensemble de réchauds destinés à la préparation de remèdes à base de plantes aromatiques et médicinales.